Чтобы обеспечить безопасность, столяру необходимо знать своё столярное дело, работать в специально предназначенной для этого одежде, правильно пользоваться столярными инструментами, при необходимости надевать средства индивидуальной защиты (перчатки, очки, респиратор и т. п.) и быть ознакомленным с правилами техники безопасности. Школьники могут изучать столярное дело под руководством опытного преподавателя (инструктора, наставника и родителей), при этом детям можно пользоваться простыми столярными инструментами, а вот дисковыми и ленточными пилами — исключено.
Самостоятельно производить столярные работы могут лица не моложе 18 лет, которые имеют соответствующую квалификацию и прошли вводный и первичный инструктажи на рабочем месте по вопросам охраны труда, правил пожарной безопасности. Также такие люди должны пройти инструктаж по охране труда для работ на сверлильном станке, имеющем переносный пневмоинструмент, для работ с ручным электроинструментом II кл., для работ на высоте, для использования грузоподъёмных машин, которые управляются с пола.
Для любой профессии очень важным является полная осведомленность в вопросах правил безопасности, вредных факторов и т.п. Если работник игнорирует некоторые правила, это может привести к профессиональным заболеваниям.
Среди профессиональных заболеваний столяра стоит назвать в основном болезни дыхательных путей (как рак носовой полости или рак лёгких), травмы конечностей (отпиливание ладоней, пальцев рук, ампутация пальцев ног из-за травмы), различные травмы двигательного аппарата (позвоночник, крестец), снижение слуховых возможностей (зачастую у столяров-станочников). Названные заболевания зачастую не появляются, если соблюдать правила техники безопасности и режим работы, а также необходимо правильно пользоваться инструментами. Именно эти условия позволяют столярам сохранять работоспособность до преклонного возраста.